科技日?qǐng)?bào)記者 張夢(mèng)然
在2日發(fā)表于英國《自然·遺傳學(xué)》雜志上的一項(xiàng)研究中，安進(jìn) (Amgen)制藥屬下deCODE基因公司的科學(xué)家們展示了通過結(jié)合序列多樣性和RNA表達(dá)的數(shù)據(jù)，測(cè)量出群體規(guī)模血漿中大量蛋白質(zhì)的水平，以深入了解人類疾病和其他表型。
deCODE基因公司的科學(xué)家們使用了血漿中的5000種蛋白質(zhì)，這些蛋白質(zhì)以群體規(guī)模的多重平臺(tái)為目標(biāo)，以解開它們的遺傳決定因素以及它們與人類疾病和其他特征的關(guān)系。
利用技術(shù)平臺(tái)“SOMAscan”的蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)定法測(cè)量的血漿蛋白質(zhì)水平，deCODE基因公司的科學(xué)家們測(cè)試了2700萬個(gè)序列變異與35559名冰島人血漿中4719種蛋白質(zhì)水平的關(guān)聯(lián)。他們發(fā)現(xiàn)了18084個(gè)序列變異與蛋白質(zhì)水平之間的關(guān)聯(lián)，其中19%與通過全基因組測(cè)序確定的罕見變異相關(guān)?？傮w而言，93%的關(guān)聯(lián)是新穎的。此外，他們分別基于“SOMAscan”方法和基于抗體的OLINK精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)分析，從現(xiàn)有最大的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究中重復(fù)了83%和64%的報(bào)告關(guān)聯(lián)。
科學(xué)家們測(cè)試了血漿中蛋白質(zhì)水平與373種疾病和其他特征的關(guān)聯(lián)，并產(chǎn)生了257490個(gè)這樣的關(guān)聯(lián)。他們整合了序列變異與蛋白質(zhì)水平、疾病和其他特征的關(guān)聯(lián)，發(fā)現(xiàn)已報(bào)告的與疾病和其他特征相關(guān)的大約5萬個(gè)變異中的12%，也與蛋白質(zhì)水平相關(guān)。
deCODE基因公司首席執(zhí)行官、該論文的資深作者之一凱瑞·斯蒂凡森表示，蛋白質(zhì)組學(xué)可以幫助解決遺傳研究中的一個(gè)主要難題：確定哪個(gè)基因負(fù)責(zé)序列變異對(duì)疾病的影響。此外，蛋白質(zhì)組還提供了一些時(shí)間相關(guān)的測(cè)量方法，因?yàn)檠褐械牡鞍踪|(zhì)水平會(huì)隨著事件發(fā)生和發(fā)生的時(shí)間而上升和下降。
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